Il funzionamento dell'MSH di Bordeaux è guidato da una serie di principi quadro .

Le sue missioni sono:

Dispiegamento di relè : dispiegare e ancorare territorialmente sistemi nazionali come infrastrutture di ricerca SHS molto grandi, azioni di valorizzazione coordinate, azioni nazionali a favore delle TSI.

Pooling : offrire servizi condivisi di supporto alla ricerca a tutte le UR che coprono, al CNRS e alle università .

Incubazione : essere organizzata secondo una logica di trasversalità rispetto alle unità, capace di cristallizzare iniziative di ricerca che alimentano il cuore scientifico delle unità .

La federazione : (1) riunisce le unità di un sito per un particolare progetto; (2) svolgere un ruolo importante nel guidare e strutturare la comunità scientifica SHS del sito.

Apertura all'internazionale : attore dell'internazionalizzazione, l'MSH di Bordeaux contribuisce ad una migliore presenza e ad un migliore coordinamento dell'SHS francese a livello internazionale.

Ricerca progettata da e per il territorio:
l'identità scientifica si basa sui punti di forza del sito, sensibile alla specificità del territorio neo-aquitano.
Il contesto scientifico e territoriale neo-aquitano è caratterizzato da alcune specificità che fanno da sfondo alle scelte scientifiche proposte.

Un terreno linguisticamente e culturalmente plurale.
La Nuova Aquitania è oggi lo spazio di tre lingue patrimoniali: francese, basco e occitano…

Uno spazio universitario altamente strutturato.
L'MSH di Bordeaux è sostenuto dall'Università di Bordeaux Montaigne , dall'Università di Bordeaux e dall'INP di Bordeaux che offrono una notevole complementarità, e dal CNRS .

Uno spazio transfrontaliero.
Il territorio della neo-Aquitania confina con tre territori della Spagna settentrionale…

Un’occasione per interrogare l’uomo e le discipline umanistiche.
Il territorio neo-aquitano è il teatro privilegiato di una lunga storia la cui estensione abbraccia la categoria stessa dell'umanità.
La regione è uno spazio archeologico unico e sede di una documentazione archeologica che conserva tracce di tutte le grandi transizioni dell'umanità.